Краткая аннотация и научное обоснование:
Механизмы адаптаций живых организмов к существованию в экстремальных условиях представляют большой интерес для прикладных и фундаментальных исследований. В особенности, механизмы устойчивости к ионизирующему излучению, высокой минерализации окружающей среды, воздействию тяжелых металлов, высоких и низких температур, высокому давлению. В условиях увеличения уровня радиационного фона за счет различных техногенных составляющих, проблемы космического излучения, препятствующего длительному пребыванию живых организмов в космосе, необходимости защиты от радиации здоровых тканей в ходе лучевой терапии злокачественных опухолей и ряда общих механизмов, лежащих в основе старения клеток и их повреждения ионизирующим излучением, изучение новых механизмов увеличения радиорезистентности является одним из важнейших направлений молекулярной биологии и радиобиологии.

Представители Tardigrada (тихоходки) относятся к группе наиболее устойчивых к различным видам стресса животных на Земле, в том числе тихоходки способны выживать после воздействия как редко- так и плотно ионизирующего излучения в дозах около 5 кГр.

Белок Dsup является новым белком, открытым в 2016 году в тихоходке Ramazzottius varieornatus – одном из самых радиорезистентных видов многоклеточных организмов. Ранее нами были созданы линии D. melanogaster и культура клеток человека HEK293, экспрессирующие данный белок, для которых мы показали значительное увеличение радиорезистентности в ходе облучения разными видами ионизирующего излучения. Для линий D.melanogaster, экспрессирующих Dsup, был проведен транскриптомный анализ, выявивший влияние белка Dsup на ряд процессов на клеточном и организменном уровне. Полученные нами результаты были опубликованы в 2023 г. в журнале iScience (Q1) (https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.106998). В ходе проведенных экспериментов по определению структуры белка Dsup впервые была произведена оценка физических размеров молекулы белка Dsup, установлены некоторые параметры комплекса ДНК-Dsup и показано существование возможной вторичной структуры белка Dsup.

Решаемые в ходе выполнения проекта задачи являются новыми и важным не только для фундаментальной молекулярной биологии и радиобиологии, но и для прикладных направлений биотехнологии, космических исследований и других дисциплин, требующих повышения уровня радиорезистентности организмов. 

Ожидаемые результаты по завершении проекта:
Создание регулируемой схемы экспрессии гена, кодирующего белок Dsup, в модельном объекте melanogaster для разработки управляемой системы временного повышения радиорезистентности всего организма.

Оценка влияния белка Dsup на компактизацию хроматина в клетках для установления фундаментальных характеристик работы белка Dsup и картирование новых регуляторных элементов в геноме melanogaster.

Получение данных о стабильности и свойствах белка Dsup в ходе воздействия высоких температур и ионизирующего излучения для оценки применения этого белка для фармакологии и медицины, как криопротектора, консерванта и стабилизатора вакцин и других ДНК\РНК содержащих препаратов, а также как протекторного агента при радио- и химиотерапии.

Разработка методики и материала для выделения нуклеиновых кислот из растворов и концентрирования ДНК и РНК из различных биологических жидкостей с помощью белка Dsup.

Ожидаемые результаты проекту в текущем году:
Оценка индуцированной радиорезистентности линий D.melanogaster, экспрессирующих Dsup под контролем промотора гена металлотионеина, и оценка изменения уровня транскрипции таргетных генов в случае индукции промотора разными концентрациями соединений меди и воздействия выоких доз радиации (500-1000 Гр).

Определение структурных характеристик комплекса Dsup-ДНК и определение константы диссоциации Dsup-ДНК  методами криоэлектронной микроскопии и МСТ (microscale thermophoresis).